primer5官方版是用户生物学领域的测序引物以及杂交探针的设计软件,软件功能非常的丰富,能够帮助显示各种生物参数,将分析结果完整呈现出来。
该软件就是用来进行引物设计的。可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物,而在手动的任何时候,下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等。也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来。而且进行这些操作非常简单。
1、主要界面是分为GeneTank(序列编辑)、Primer(引物设计)、Aling(序列比较)、Enzyme(酶切分析)和Mitif(基序分析)。
2、该软件就是用来进行引物设计的
3、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物
4、在手动的任何时候,下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等,也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来
5、使用Primer Premier,操作非常简单
1、病理检测引物设计
可以用在高保区域设计引物
2、种间交叉引物设计
利用来自多个物种的序列设计扩增引物
3、等位基因特效引物
设计专用于扩增某一类相关序列中特定成员的引物
1、先在NCBI这个网站上找到自己需要的基因序列,mRNA或者DNA都可。
2、运行Primer 5.exe。
3、点击左上角File-New-DNA Sequence。
4、将自己得到的DNA或者RNA粘贴至空白处。
5、贴之后会弹出窗口,系统自动选择“As is”,直接点击OK即可。
6、粘贴成功,点击“primer”,在左上方弹出窗口,选择“search”,弹出引物搜索框,其他选项一般不需要更改,如果需要的产物长度有些要求可以更改,如果无需更改,或者更改完毕后点击“OK”。
7、自动搜索完毕后,点击“OK”,右上角出现搜索结果,并且按系统评分排序,共一百对引物。
8、点击某一行结果,在左上角的“引物窗口”中,会显示该引物的详细信息。
9、通过对比查看引物,从中选择合适的引物:在搜索结果框中该引物一行的方框后打对勾。点击Fuction-Save to datebase,弹出“primer database ”对话框,点击自己要加的引物序列,点击“Export”,引物序列就会在“Primers”下方出现,点击“Save”,以后即可查看。
10、如果合适的引物就一两个,也可以直接用虚拟打印机转化成pdf格式。前提是要有一个虚拟打印机的软件,我用的是bio PDF软件。点击合适的引物,点击File-Print-Current Pair,弹出“Print primer”窗口,点击“print”。
11、弹出“打印设置”选项,直接确定即可,弹出PDF生成文件,点击“保存”,在桌面上就有了该pdf文件,文件里面记录该序列详细信息。
三维设计软件非常的实用,设计师可以通过三维测绘软件来设计出不同的三维视图效果.小编这里也为大家推荐常见的三维贴图软件有CAD、3DMAX、PRO/E、Solidworks等.我们来逐一了解一下,大家可以根据自己的需要下载
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